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（1）教学模式与方法创新
提出了涵盖招生、培养、就业的“全程多维”实践教学模式，强化了入学、毕业论文、第二课堂、就业环节的实践考核，理论创新较强。
通过增设《运输管理决策模拟》等课程、竞赛替代学分、扩大选修课范围，实现培养方案由“刚性”向“柔性”转变。
设计基于智能教学平台的线上线下混合式翻转课堂教学方法，研发了MicroCity等课程软件。
基于校际合作，上海交大接收大连海大推免生攻读硕士学位，通过本硕“连读”，保证实践能力提升的连续性，示范效应明显。
（2）资源整合模式创新
导师队伍共组共享。创新设立双思政导师、导师组“帮带制”、导师“双培训”等制度，两校实现了师资的共享、互访。
教学平台与基地共建共享。建成智慧港口全球创新实验室、大型智能交通虚拟仿真演示系统等平台，涌现海大实习船等独具海洋物流特色的十大品牌基地。
教材与案例库共建共享。出版《综合交通运输学》等规划教材，开发多套教学案例库，在交通运输工程学、现代物流与供应链管理等课程，实现了案例教学、教材、案例库一体化，填补了物流工程专业学位案例库及特色教材建设的空白。
国际合作平台共建共享。实施“走出去、请进来”策略，整合国际资源，比如，通过大连海大斯里兰卡校区、校际交换项目、与世界海事大学合作举办“海上安全与环境管理硕士班”等形式，实现了航海教育首次输出。
（3）蓝色育人平台创新
建立以思政课为核心圈，海运特色课程、综合素养课程、专业教育课程多层次互补的“课程思政”拓展圈，以第二课堂思辨、实践平台拓展、校园文化为浸润圈的“三圈层”课程思政育人体系，形成“流动国土”—实习船、“流动基地”—曲建武名师工作室、“流动课堂”—“海洋历史与文化”在线课程等在内的“N—TIME流动思政”品牌；上海交大探索社会实践与课程思政融合育人机制，组建的导师与思政教师团队，成为上海高校唯一一个“知行杯”特等奖五连冠的团队、13次获得上海交大社会实践十佳项目。